Sekolah Tinggi Teologi Amanat Agung (STTAA) didirikan dari beban untuk menghasilkan pekerja-pekerja Allah yang bermutu bagi pekerjaan penuaian di ladang TUHAN. Setelah digumulkan kurang lebih 5 tahun sejak tahun 1992 oleh Majelis dan para Hamba TUHAN Gereja Kristus Jemaat Mangga Besar (GKJMB) Jakarta - kini Sinode Gereja Kristus Yesus (GKY), Yayasan Amanat Agung Indonesia yang menaungi Sekolah Tinggi Teologi Amanat Agung resmi didirikan pada tanggal 9 September 1996.